2'-F-dU foszforamidit

A 2'-F-dU foszforamidit a 2′-fluor-2′-dezoxiuridint szintetikus oligonukleotidokká építi be. A 2′-fluor-módosítás drámaian megnöveli a komplementer RNS-sel képződött duplexek termikus stabilitását (ΔTm ≈ +2–3°C módosításonként) a DNS-hez vagy akár a 2′-O-metil-RNS-hez képest, miközben kivételes ellenállást biztosít a nukleázlebontással szemben. A 2'-F-dU foszforamidit különösen értékes az siRNS tervezésében, ahol a szensz szál 2'-F módosításai csökkenthetik a célon kívüli hatásokat és fokozhatják a metabolikus stabilitást az RNSi aktivitás veszélyeztetése nélkül. A 2'-F-dU foszforamiditet az aptamerek fejlesztésében is használják, mivel a 2'-F módosítás kiterjeszti az aptamer könyvtárak kémiai sokféleségét és javítja az in vivo felezési időt. Az uridinbázis nem igényel exociklusos amin védőcsoportot (ellentétben a C-vel, A-val vagy G-vel), így a 2'-F-dU foszforamidit védőcsoportja egyszerűbben eltávolítható – a standard koncentrált ammónia vagy AMA-kezelés eltávolítja a ciano-etil-csoportot, és lehasítja az oligonukleotidot a hordozóról, további lépések nélkül a bázis eltávolításához. A 2'-F-dU foszforamidit teljes mértékben kompatibilis a szabványos DNS/RNS szintetizátorokkal, bár előfordulhat, hogy a kapcsolási időt meg kell hosszabbítani (6-10 perc) a fluoratom elektronszívó hatása miatt.

Termékparaméterek

Miért Cosperpharm? – Versenyelőnyeink

Szintetikus útvonal

5'-O-(4,4'-dimetoxi-trifenil-metil)-2'-dezoxi-2'-fluor-uridint (3,00 g, 5,47 mmol) argon elleni védelem alatt feloldunk 50 ml vízmentes diklór-metánban. N,N-diizopropil-etil-amint (0,55 ml, 3,18 mmol), 1H-tetrazolt (0,45 g, 6,45 mmol) és bisz(2-ciano-etil-amino)(2-ciano-etoxi)-foszfint (1,92 g, 6,36 mmol) adtunk hozzá egymás után. A reakcióelegyet egy éjszakán át szobahőmérsékleten keverjük. Miután a befejeződést vékonyrétegkromatográfiás vizsgálattal igazoltuk, 5%-os vizes nátrium-hidrogén-karbonát-oldatot (20 ml) adtunk hozzá a rétegek elválasztására; a szerves fázist telített sóoldattal (20 ml) mostuk. Vízmentes nátrium-szulfáttal való szárítás után a szerves fázist csökkentett nyomáson bepároljuk. A nyersterméket szilikagélen oszlopkromatográfiásan tisztítjuk, 3% trietil-amint (75:25-30:70, v/v) tartalmazó hexán/etil-acetát elegy alkalmazásával. A célterméket tartalmazó frakciót összegyűjtöttük és csökkentett nyomáson betöményítettük (2R,3R,4R,5R)-2-(bisz(4-metoxi-fenil)(fenil)metoxi)-metil)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihidropirimidin-1(2H)-il)-4-fluor-4-hidroxi-tetrahidrofurán-3-il(2-ciano-etil)-dizo-6-izopropil. 67,3%).

Minőségbiztosítás a Cosperpharmnál

Minden tétel a következőkön megy keresztül:

● Gázkromatográfia (GC) – tisztaság ≥97,0%

● Nem vizes titrálás – tisztaság ≥97,0%

● Refractive index – megerősítő elemzés

● ¹H NMR – szerkezeti ellenőrzés

● Megjelenés – színtelentől a világossárgáig a világos narancsig terjedő átlátszó folyadék

Minden szállítmányt átfogó COA, MSDS (teljes GHS-információkkal) és származási bizonyítvány kísér.

Lépjen kapcsolatba velünk

Megbízható 2'-F-dU foszforamidit-forrásra van szüksége az oligonukleotid szintézis programjához? A Cosperpharm nagy tisztaságú monomert, teljes analitikai dokumentációt és szakértői műszaki támogatást biztosít a kutatástól a kereskedelmi méretig. Vegye fel velünk a kapcsolatot még ma.